L'agence de l’eau soutient des actions multithématiques pour l'adaptation des territoires au changement climatique dans le domaine de l'eau.
Face aux défis tels que l'assèchement des sols et la diminution du niveau des aquifères, elle encourage l'élaboration de stratégies territoriales intégrant les enjeux des ressources en eau et des milieux aquatiques. L'agence favorise des approches systémiques au niveau des bassins versants et soutient l'animation, les études et les plans d'action via des contrats Eau et Climat. Elle peut également financer des projets innovants et exemplaires pour répondre aux enjeux identifiés dans le plan de bassin d'adaptation au changement climatique.